بیوتکنولوژی و تنش های زنده و غیرزنده
راحیل دولت آبادی؛ هاجر شایسته؛ امین میرشمسی کاخکی؛ محمد زارع مهرجردی؛ علیرضا سیفی
چکیده
گل جالیز گیاه انگلی است که باعث کاهش قابل توجهی در تولید محصولات زراعی میشود و کنترل آن نیز در شرایط مزرعه دشوار است. در این مطالعه تجزیهوتحلیل دادههای RNA-seq موجود در NCBI، همراه با تایید آزمایشگاهی بخشی از نتایج حاصل گزارش میشود. پس از ارزیابی کیفیت خوانشهای خام آلومینا، خوانشهای با کیفیت قابل قبول روی ترنسکرپتوم گلجالیز ...
بیشتر
گل جالیز گیاه انگلی است که باعث کاهش قابل توجهی در تولید محصولات زراعی میشود و کنترل آن نیز در شرایط مزرعه دشوار است. در این مطالعه تجزیهوتحلیل دادههای RNA-seq موجود در NCBI، همراه با تایید آزمایشگاهی بخشی از نتایج حاصل گزارش میشود. پس از ارزیابی کیفیت خوانشهای خام آلومینا، خوانشهای با کیفیت قابل قبول روی ترنسکرپتوم گلجالیز نقشهیابی شدند. پس از آنالیز بیان ژن با استفاده از نرم افزار DESeq، 391 ژن دارای بیان متفاوت در مرحله آبنوشی بذر گلجالیز و مرحل اتصال گلجالیز به ریشه میزبان شناسایی شد. بیان اورتولوگ این ژنها در خویشاوندان نزدیک گل جالیز، که غیر انگل یا نیمه انگل هستند، نیز بررسی شد. از بین 391 ژنی که بین مرحله آبنوشی و اتصال به میزبان در گل جالیز تفاوت بیان معنی داری داشتند، 87 ژن در خویشاوند انگل گلجالیز نیز بیان بالایی در زمان اتصال به میزبان داشتند، در حالیکه این ژنها در خویشاوند غیر انگل بیان نمیشدند. بر این اساس این 87 ژن بهعنوان ژنهای کاندید دخیل در استقرار رابطه انگلی با میزبان در نظر گرفتهشدند. در ادامه الگوی بیان نُه ژن از این ژنهای کاندید انتخابی در بافت رویشی، گل، و بافت محل اتصال گلجالیز به گوجهفرنگی بررسی شد. نتایج نشان داد که ژن کدکننده سرینکربوکسیپپتیداز الگوی بیان مورد انتظار برای ژنهای دخیل در ایجاد رابطه انگلی را دارد به نحوی که تنها در بافت محل اتصال به میزبان بیان میشود. نتایج این مطالعه میتواند برای اهداف مهندسی ژنتیک گوجهفرنگی برای ایجاد مقاومت به گل جالیز از طریق خاموشی ژن در میزبان مورد استفاده قرار گیرد.
بیوتکنولوژی و تنش های زنده و غیرزنده
ولی اله قاسمی عمران؛ عبدالرضا باقری؛ قربانعلی نعمت زاده؛ امین میر شمسی؛ نادعلی بابائیان جلودار
دوره 2، شماره 2 ، شهریور 1391، ، صفحه 27-37
چکیده
شوری و به طور عمده کلرید سدیم، از رشد گیاهان جلوگیری نموده و سبب کاهش تولیدات کشاورزی میگردد. در گیاهان عالی دفع و حجره بندی سدیم بواسطه آنتی پورترهای موجود در غشاهای پلاسمایی و واکوئلی انجام می شود. در این مطالعه، الگوی بیان ژنهای AlNHX و AlSOS1 در پاسخ به تیمار شوری 250 میلی مولار کلرید سدیم در زمان های 6 ساعت، 1، 3، 8 و 17 روز ...
بیشتر
شوری و به طور عمده کلرید سدیم، از رشد گیاهان جلوگیری نموده و سبب کاهش تولیدات کشاورزی میگردد. در گیاهان عالی دفع و حجره بندی سدیم بواسطه آنتی پورترهای موجود در غشاهای پلاسمایی و واکوئلی انجام می شود. در این مطالعه، الگوی بیان ژنهای AlNHX و AlSOS1 در پاسخ به تیمار شوری 250 میلی مولار کلرید سدیم در زمان های 6 ساعت، 1، 3، 8 و 17 روز پس از اعمال تنش با استفاده از تکنیک Real Time-PCR در گیاه Auleropus مورد بررسی قرار گرفت. سطوح نسخه برداری دو ژن در پاسخ به تنش در همه بافت ها افزایش یافت. بیان ژن AlSOS1 در بافت برگ پس از 6 ساعت افزایش یافت و بیان ژنAlNHX پس از 24 ساعت از اعمال تنش به بالاترین میزان خود رسید. در بافت گره و میانگره سطوح نسخه برداری هر دو ژن، 24 ساعت پس از اعمال تنش به شدت افزایش یافت و سپس در 3 و 8 روز بعد از اعمال تنش به تدریج کاهش یافت تا در نهایت 17 روز پس از تنش به حالت پایدار برابر با شاهد(بدون تنش)بازگشت. میزان بیان هر دو ژن در بافت های ریشه به آهستگی بعد از اعمال تنش افزایش یافت و پس از 3 روز به میزان حداکثر رسید و این میزان بیان تا 8 روز پس از تنش ادامه یافت و در ژن AlNHX پس از 17 روز به حالت پایدار برابر با شاهد بازگشت، در حالی که در مورد ژن AlSOS1 پس از 17 روز همچنان بیان دو برابر شاهد بود