کشاورزی مولکولی
سید جواد داورپناه؛ مجید دانا؛ غلامرضا بخشی خانیکی؛ امیر عباس مختاریه
چکیده
لاکازها گروهی از گلیکوپروتئینها با ویژگی پلیفنلاکسیدازی هستند که میتوانند ترکیبات گوناگونی را اکسید نمایند. این گروه آنزیمی در گیاهان، قارچها، حشرات و باکتریها بیان میشوند و دارای نقشهای مهمی در فعالیتهای زیستی و کاربردهای گوناگونی در صنایع غذایی، دارویی، نساجی و حتی نظامی میباشند. با توجه به ساختار این آنزیم و اینکه ...
بیشتر
لاکازها گروهی از گلیکوپروتئینها با ویژگی پلیفنلاکسیدازی هستند که میتوانند ترکیبات گوناگونی را اکسید نمایند. این گروه آنزیمی در گیاهان، قارچها، حشرات و باکتریها بیان میشوند و دارای نقشهای مهمی در فعالیتهای زیستی و کاربردهای گوناگونی در صنایع غذایی، دارویی، نساجی و حتی نظامی میباشند. با توجه به ساختار این آنزیم و اینکه تشکیلات بیان پروتئین در گیاهان قادر به تولید کامل پروتئینها ازجمله گلیکوپروتئینها میباشند به جهت کاربرد در پالایش زیستی، سازهای طراحی گردید که لاکاز II قارچی تحت کنترل پیشرانه باکتریایی ویژه بیان در ریشه مانوپین سنتاز و تشدیدکننده ترجمه Tobacco Etch Virus در گیاه توتون بیان شود. افزودن سیگنال پپتید اندوکیتیناز اسیدی Q توتون به ابتدای آنزیم باعث ترشح آن به فضای آپوپلاستی میشود. با استفاده از واکنش زنجیرهای پلیمراز، تراریختی گیاهان توتون توسط ژن لاکاز بهوسیله آگروباکتریوم تأیید گردید. نتایج نیمهکمی بیان ترانسکریپتومیک لاکاز در ریشه و برگ تراریختهای مفروض نشانگر بیان متمایز آن در ریشه و برگ بود که ناشی از کارکرد متمایز پیشرانه باکتریایی مانوپین سنتاز میباشد. نتیجه وسترن بلاتینگ تولید پروتئین بالغ در ریشه را تأیید کرد. وجود این پروتئین بهصورت تک سایز نشانه عملکرد صحیح سیگنال پپتید و ترشح آن به فضای آپوپلاستی در ریشه توتون میباشد. با توجه به کاربرد این گیاهان جهت استخراج آنزیم یا پالایش زیستی میتوان تراریختهای موردنظر را بر اساس میزان پروتئین و فعالیت آنزیمی غربالگری و گزینش نمود.
کشاورزی مولکولی
نسیم احتشام راثی؛ احمد روحی بخش؛ بیتا سهیلی مقدم؛ ناهید مسعودی
دوره 8، شماره 22 ، شهریور 1397، ، صفحه 51-64
چکیده
ویروس S سیبزمینی (PVS) متعلق به جنس Carlavirus از تیره Betaflexiviridae یکی از ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. به منظور ردیابی ویروس S سیبزمینی، نمونهبرداری از مزارع سیبزمینی استان اردبیل، طی تابستان سالهای 95-1394، صورت گرفت. گیاهان محک در گلخانه، به منظور بررسی بیولوژیکی نمونههای برگی مشکوک به آلودگی، مایه زنی شدند. نمونهها ...
بیشتر
ویروس S سیبزمینی (PVS) متعلق به جنس Carlavirus از تیره Betaflexiviridae یکی از ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. به منظور ردیابی ویروس S سیبزمینی، نمونهبرداری از مزارع سیبزمینی استان اردبیل، طی تابستان سالهای 95-1394، صورت گرفت. گیاهان محک در گلخانه، به منظور بررسی بیولوژیکی نمونههای برگی مشکوک به آلودگی، مایه زنی شدند. نمونهها با آزمون الیزا از نظر آلودگی به ویروس PVS مورد بررسی قرار گرفتند. جهت ردیابی مولکولی، از روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مربوط به ناحیه پروتئین پوششی ویروس PVS استفاده شد. توالی نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی مربوط به دو جدایه از ویروس (با رسشمار MH159207 و MH159208) جدا شده از ارقام آگریا و اوشینا تعیین شد. توالی پروتئین پوششی دو جدایه با یکدیگر و با 29 جدایه دیگر قابل دسترسی در بانک ژن مقایسه شد. درخت تبارزایی رسم شده نشان داد که جدایهها به دو گروه اصلی I (زیرگروههای IA وIB ) و II تقسیم شدند. دو جدایه Ag-9-PVS-F و Os-11-PVS-F در زیرگروه IB همراه با جدایههای آذربایجان، کرمان، همدان و اصفهان و جدایههایی از مجارستان، اوکراین، اسکاتلند و هند قرارگرفتند. همردیفی توالی اسیدآمینه فرضی پروتئین پوششی دو جدایه مورد بررسی با شش جدایه ایرانی و پنج جدایه خارجی این ویروس بیانگر اختلاف در هشت و 25 اسیدآمینه به-ترتیب برای جدایههای Ag-9-PVS-F و Os-11-PVS-F بود. نتایج نشاندهنده وجود جدایههای متنوع ویروس PVS در کشور بوده و تفاوت در توالی اسید نوکلئوتیدی و اسید آمینهای میتواند حاکی از تفاوت در منشا جفرافیایی و به تبع آن نحوه و زمان ورود جدایههای ویروس به منطقه باشد.