دانشگاه پیام نور فصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی 2252-0783 15 2 2025 12 22 Bioinformatic identification of genes and microRNAs responsive to ethanol spraying after drought stress in Arabidopsis شناسایی بیوانفورماتیکی ژن‌ها و microRNAهای پاسخ دهنده به اتانول پاشی پس از تنش خشکی در آرابیدوپسیس 71 89 13077 10.30473/cb.2026.76193.2022 FA مریم آقاجانلو گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران. مریم پسندیده ارجمند گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران. واحد فناور زیست رادان ژن کاسپین (بیوژن تک)، مرکز رشد محمد محسن زاده گلفزانی گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران. حبیب اله سمیع زاده لاهیجی گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران. Journal Article 2025 10 19 Drought stress is one of the main factors limiting plant growth and yield under unstable climatic conditions. In this study, transcriptomic data of ethanol-treated and control plants under drought stress conditions and at time intervals of 1, 3, and 5 days after stress were extracted from the GEO database and analyzed using the GEO2R tool. Genes with significant expression changes were identified based on an adjusted p-value تنش خشکی یکی از عوامل اصلی محدودکننده رشد و بهره‌وری گیاه در شرایط آب و هوایی ناپایدار است. در این مطالعه داده‌های ترانسکریپتومی حاصل از گیاهان تیمار‌شده با اتانول و شاهد، در شرایط تنش خشکی و در فواصل زمانی ۱، ۳ و ۵ روز پس از تنش از پایگاه GEO استخراج و با استفاده از ابزارGEO2R آنالیز شدند. ژن‌های دارای تغییر بیان معنادار بر اساس مقدار adjusted p-value کمتر از 05/0 و|LogFC| بزرگتر مساوی 1 شناسایی شدند. شبکه برهم‌کنش پروتئینی با نرم‌افزار Cytoscape رسم و ژن‌های کلیدی با افزونه CytoHubba تعیین شد. مسیرهای عملکردی نیز با استفاده از ابزار DAVID و ShinyGO مورد تحلیل قرار گرفتند. همچنین microRNAهای تنظیم کننده ژن‌های کلیدی با استفاده از ابزار psRNATarget شناسایی شدند. در مجموع 1144 ژن با بیان متفاوت (DEG) شامل 567 ژن افزایش بیان یافته و 578 ژن کاهش بیان یافته شناسایی شد. ده ژن کلیدی شامل KRP1، ACS6، ZAT10، PUMP4، CAF1-11، CAF1-9، F23F1.6، NUDT21، BAP1 و F27B13.20 به عنوان تنظیم‌کننده‌های مرکزی دخیل در پاسخ به خشکی، سیگنالینگ هورمونی، دفاع در برابر استرس اکسیداتیو و تنظیم بیان ژن شناسایی شدند که خود توسط miRNAهای مهمی همچونath-miR5021 ، ath-miR854، ath-miR156 و غیره تنظیم می‌شوند. این یافته‌ها نشان می‌دهد که استفاده برون‌زا از اتانول به‌عنوان یک ترکیب ارزان‌قیمت و زیست‌سازگار، می‌تواند مقاومت گیاه به خشکی را از طریق تغییر در بیان ژن‌های کلیدی و فعال‌سازی مسیرهای دفاعی بهبود بخشد. https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_13077_91b3cd0e0272f0198415d24ee789baf7.pdf