دانشگاه پیام نورفصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی2252-0783103020200822Study the expression of SOS1, P5CS1 and PMP3-6 genes in maize under salt stressبررسی تغییرات بیان ژنهای SOS1، P5CS1 و PMP3-6 در لاین های ذرت تحت تنش شوری114710710.30473/cb.2020.52969.1807FAزهراابراهیمی پوردانش آموخته ارشد بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه تولید و ژنتیک گیاهی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه ارومیه. ایرانرضادرویش زادهاستاد، گروه تولید و ژنتیک گیاهی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران0000-0001-5991-4411سرورارژنگدانشجوی دکتری اصلاح نباتات- ژنتیک مولکولی و مهندسی ژنتیک، گروه تولید و ژنتیک گیاهی دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران.Journal Article20200510High concentration of salt in soil and water is one of the major factors limiting crop growth and production worldwide. A factorial experiment based on completely randomized design with two biological and three technical replicates was performed in 2018-2019 to study the ion leakage rate and chanes in relative expression of SOS1, P5CS1 and PMP3-6 genes in the root and leaf of Zea mays L. tolerant and susceptible lines under normal and 8 dS/m salinity conditions using real-time PCR technique after 24-hours and 7-days (as short-time and long-time, respectively) of applying salt stress. The results showed that ion leakage rate at long-time was high in the susceptible line than that of the tolerant line. The highest relative expression of P5CS1 and PMP3-6 genes in 8 dS/m salinity stress was observed in the roots of tolerant line. In contrast, the highest increase in the reltive expression of SOS1 gene was observed in the leaf tissue of susceptible line at short-time. Correlation analysis among the relative expression of studied genes revealed a positive significant correlation (P≤0.05) between P5CS1 and PMP3-6 genes expression. Probabiliy, the high expression of PMP3-6 and P5CS1 genes in the root tissue of the tolerant line in the ealier time post salt stress application is responsible for regulating osmotic pressure and preventing excessive Na+ entry into the plant that results in icreasing the tolerance of plant to salt stress. The results of this study can be useful in Zea mays L. breeding programs for producing salinity tolerant varieties.غلظت بالای نمک در آب و خاک یکی از عمدهترین عوامل محدود کننده رشد و تولید گیاهان در سراسر جهان است. در این مطالعه، میزان نشت یونی و تغییرات بیان نسبی ژنهای SOS1، P5CS1 و PMP3-6 در ریشه و برگ لاینهای متحمل و حساس ذرت تحت شرایط نرمال و تنش شوری dS/m8، در زمانهای 24 ساعت (کوتاه مدت) و 7 روز (بلند مدت) بعد از اعمال تنش در قالب طرح کاملاً تصادفی با دو تکرار زیستی و 3 تکرار تکنیکی در سال 1398 با فناوری واکنش زنجیره ای پلی مراز در زمان واقعی مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد میزان نشت یونی در لاین حساس در بلند مدت بیشتر از لاین متحمل بود. بیشترین میزان بیان نسبی دو ژن P5CS1 و PMP3-6 در شرایط تنش شوری (dS/m 8) در بافت ریشه لاین متحمل مشاهده شد. در مقابل بیشترین میزان بیان نسبی ژن SOS1 در بافت برگ لاین حساس در کوتاه مدت مشاهده شد. محاسبه همبستگی بین بیان نسبی ژنها نشان داد بین بیان نسبی ژنهای P5CS1 و PMP3-6 همبستگی مثبت و معنیداری (05/0P≤) وجود دارد. احتمالاً بیان بالای ژنهای P5CS1 و PMP3-6 در ریشه لاین متحمل اندکی بعد از اعمال تنش شوری (کوتاه مدت) گیاه را در تنظیم فشار اسمزی و جلوگیری از ورود زیاد سدیم به درون گیاه یاری نموده و باعت افزایش تحمل گیاه به تنش شوری می شود. نتایج این پژوهش میتواند در برنامههای بهنژادی ذرت برای تولید ارقام مقاوم به شوری مفید واقع شود.https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_7107_3659d32a11c8eb03c17008371fd9d242.pdfدانشگاه پیام نورفصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی2252-0783103020200922Optimization of hairy root production for Stevia rebaudiana Bertoni through inoculation by Agrobacterium rhizogenesبهینهسازی شرایط رشد ریشههای مویین گیاه Stevia rebaudiana Bertoni حاصل تلقیح Agrobacterium rhizogenes1529710810.30473/cb.2020.53538.1809FAرقیهشریف پوردانشجوی کارشناسی ارشد، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران.محمد علیاعظمیاستادیار، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران.محمدباقرحسنپور اقدمدانشیار، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه مراغه، مراغه، ایران و دانشیار پژوهشی مرکز پژوهشهای مجلس شورای اسلامی، تهران، ایران.Journal Article20200613Stevia rebaudiana Bertoni is a perennial shrub from the Asteraceae; native of Brazil and Paraguai. This Plant is containing sweet steviosides; rebaudioside and isostevol. This experiment was conducted to study the effects of diverse factors on induction and growth of hairy roots induced by Agrobacterium rhizogenes. The seeds were surface sterilized and then cultured on solid MS medium under 250C and 16:8 h photoperiod. After germination and development of seedlings, the root, stem and leaf explant of three different ages (30, 60 and 90 days) were placed on NYA and LB suspension media. Agrobacterium rhizogenes strains (ATTCC15834, R1000 and C58) and acetosyringone were treated on the plant sample by floating and spray method for 72 hrs at 270C. The incubated explants were treated to remove any bacteria and were transferred to 1/2MS media containing 400 mgl-1 cefotaxime. To optimize the growing media for hairy root induction and growth, 1/2 MS medium was enriched with 3% sucrose and 0.2 mgl-1 Indole-3-butyric acid. The results revealed that all the Agrobacterium strains were effective on hairy root induction from root and leaf explant. The highest hairy root induction was belonged to NYA suspension medium co-cultured with 1/2 MS. Furthermore, for the roots proliferation, 1/2MS medium containing 1/5% sucrose was the selected one. Leaf clone (C2LA) stevia lines obtained from ATCC15834 strain had the highest growth.گیاه دارویی استویا Stevia rebaudiana Bertoni درختچه چند ساله کوچکی از خانواده Asteraceae است که بومی جنوب آمریکا، بهویژه برزیل و پاراگوئه، میباشد. این پژوهش بهمنظور بررسی تأثیر عوامل مختلف در القا و رشد ریشههای مویین توسط آگروباکتریوم رایزوژنز در گیاه استویا صورت گرفت. بذور استویا در شرایط درونشیشهای کشت شدند. پس از جوانهزنی و رشد گیاهچهها، ریزنمونههای قطعات ریشه، ساقه و برگ در سنین 30، 60 و 90 روزه از گیاهچههای درون شیشهای بهدست آمد. سویههای ATCC15834، R1000 وC58 آگروباکتریوم رایزوژنز (حاوی صفر و 100 میکرومولار استوسرینگون) در دو محیط کشت NYA و LB با روش غوطهوری و اسپری بهمدت 72 ساعت در دمای 27 درجه سانتیگراد همکشت گردیدند. ریزنمونههای تلقیح شده بعد از حذف باکتری اضافی به محیط 1/2MS و MS جامد حاوی 400 میلیگرم بر لیتر آنتیبیوتیک سفوتاکسیم منتقل گردیدند. بهمنظور بهینهسازی محیطکشتهای مختلف بر رشد ریشههای مویین در محیط کشت مایع، از محیط1/2MS با غلظتهای 5/1% و 3 % ساکارز و IBA 2/0 میلیگرم بر لیتر استفاده شد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد هر سه سویه آگروباکتریوم بر القای ریشه مویین در ریزنمونه برگ استویا مناسب بودند ولی، سویه ATCC15834 قابلیت بیشتری در القای ریشههای مویین داشت. بیشترین میزان فراوانی ریشه مویین در محیط سوسپانسیون NYA و محیط همکشتی 1/2MS بود. همچنین در مرحله پرآوری ریشههای مویین محیط 1/2MS دارای 5/1درصد ساکارز مناسب-ترین محیط شناخته شد. لاینهای حاصل از سویه ATCC15834 استویا، کلون برگ (C2 LA) پررشدترین لاین بود.https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_7108_c2b9050133190ea89ebaf45905c496d7.pdfدانشگاه پیام نورفصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی2252-0783103020200922Differential expression of HSP90 ,AGO1 and AGO4 genes in tomato infected by Cucumber mosaic virusبیان افتراقی ژنهای HSP90 و AGO1 و AGO4 گوجه فرنگی در مواجهه با ویروس موزاییک خیار3142711110.30473/cb.2020.53550.1811FAندااصغریکارشناسی ارشد، بیماریشناسی گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایرانداودکولیوندگروه گیاهپزشکی. دانشکده کشاورزی. دانشگاه زنجان0000-0002-5863-2591امیدعینیدانشیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران.Journal Article20200531Cucumber mosaic virus (CMV) is a type member of Cucumovirus genus in the family Bromoviridae. In this research, the expression profile of several genes related to development and methylation was tested in a sensitive variety of tomato infected by CMV-Fny. Tomato inoculation was carried out using a standard isolates of CMV (Fny). To this aim, transcripts of RNA1, RNA2 and RNA3 of CMV were transcribed and then, inoculated using sap inoculation on tobacco plants at the four-leaf stage. After symptoms induction, leaf samples were collected at 7, 14 and 21 days post inoculation (dpi). The virus infection was confirmed by RT-PCR using CMV-CP specific primers corresponding coat protein gene. The expression of several genes related to development and methylation including Hsp90, AGO1 and AGO4 was tested by real-time PCR. The results showed that the expression of HSP90 was decreased after infection by CMV compared to healthy plans. In addition, the expression of AGO1 was increased at 7 and 14 dpi whereas the expression was decreased compared to healthy plans at 21 dpi. The expression of AGO4 which has the role in plant defense was increased in infected tomato plants at 14 and 21 dpi and AGO4 expression was decreased compared to healthy plant in 7 dpi. It seems, changes in AGOs expression refer to late induction of plant resistance against the virus infection.ویروس موزاییک خیار Cucumber mosaic virus (CMV) گونه شاخص جنس Cucumovirus از خانواده Bromoviridae است. در این تحقیق بیان برخی ژنهای مرتبط با رشد و نمو و متیلاسیون در یک رقم حساس گوجهفرنگی آلوده به ویروس موزاییک خیار بررسی شد. برای آلودهسازی گوجهفرنگی از همسانههای آلودهگر جدایه استاندارد Fny ویروس موزاییک خیار استفاده شد. بدین منظور پس از تهیه نسخههای رونویسی شده از همسانههای آلودهگر آرانای یک، دو و سه ویروس موزاییک خیار، رونوشتها ابتدا روی توتون در مرحله چهاربرگی مایهزنی شدند و پس از ظهور علائم و ایجاد آلودگی، عصاره گیاه توتون آلوده بهصورت مکانیکی روی گوجه فرنگی در مرحله چهاربرگی مایهزنی شد. پس از بروز علائم در چندین مرحله از گیاهان آلوده در فاصلههای زمانی 7، 14 و 21 روز پس از مایهزنی، نمونهبرداری از برگهای آلوده انجام گرفت. پس از استخراج آرانای کل از گیاهان دارای علائم حضور ویروس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ویروس منطبق بر بخشی از ژن پروتئین پوششی تأیید شد. بیان برخی از ژنهای مرتبط با دفاع و متیلاسیون مانند Hsp90، AGO1 وAGO4 توسط Real Time PCR اندازهگیری شد. نتایج نشان داد که میزان بیان برخی از ژنها مانند HSP90 در گوجهفرنگیهای آلوده کاهش یافته بود. همچنین بیان ژن AGO1، در روز هفتم و چهاردهم پس از آلودگی در مقایسه با گیاه سالم افزایش یافت، در حالیکه در روز 21 پس از آلودگی میزان بیان این ژن نسبت به گیاه سالم کاهش یافت. بیان AGO4 در گیاهان آلوده به ویروس موزاییک خیار، در روز هفتم نسبت به گیاه سالم کاهش اما در روز 14و 21 روز پس از آلودگی، افزایش بیان نشان داد. تغییرات بیان ژن در AGO احتمالاً میتواند ناشی از تاخیر در القای این ژن توسط ویروس در مرحله اول بروز علایم باشد.https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_7111_607a2446f98bbd28d80011ab5f03ddee.pdfدانشگاه پیام نورفصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی2252-0783103020200919Effect of Rhizoglomus irregulare symbiosis on reducing disease severity in tomato plants infected with Tomato bushy stunt virus with emphasis on the expression of methylation- related genesتاثیر همزیستی قارچ مایکوریز Rhizoglomus irregulare بر کاهش شدت آلودگی گیاه گوجه فرنگی به ویروس کوتولگی بوته با تاکید بر بیان ژنهای دخیل در متیلاسیون4355711310.30473/cb.2020.54419.1818FAنداخوش خطیدانشجوی دکتری گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران.امیدعینیدانشیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران.داودکولیونداستادیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان، زنجان، ایران.0000-0002-5863-2591Journal Article20200703Tomato bushy stunt virus (TBSV), a member of the genus Tombusvirus is one of the causal agents for curly disease in tomato plants. In this study, the interaction between a mycorrhizal fungus, Rhizoglomus irregular, and TBSV in tomato plants was investigated. In a completely randomized design experiment, tomato seedlings were inoculated with R. irregular and after four weeks they were inoculated with TBSV. Four treatments were included: control plants (C), TBSV -infected plants (V), mycorrhizal plants (M), TBSV -infected mycorrhizal plants (MV). Nineteen days after inoculation the infected plants were tested for symptom production and virus accumulation. Results of symptoms evaluation based on the disease severity index showed a lower disease severity in MV plants compared with V plants. Supporting this result, a lower level of virus accumulation was observed in V plants which was more significant at long-term infection. The expression of methylation-related genes including ADK, HEN1 and MET1 was tested by Real-time PCR. Results showed that the expression of these genes was significantly higher in MV plants as compared with V plants. An increase in the expression of methylation-related genes in MV plants indicates that resistance to the virus is likely to occur through methylation and also supports the lower level of virus accumulation in MV plants.با توجه به اهمیت اقتصادی ویروس کوتولگی بوته گوجهفرنگی (TBSV-Tomato bushy stunt virus) در مزارع سراسر جهان، در این پژوهش ارتباط میان قارچ مایکوریزایی Rhizoglomus irregulare و ویروس کوتولگی بوته گیاه گوجهفرنگی بررسی گردید. به این منظور، در زمان نشاکاری گوجهفرنگی، مایه تلقیح مایکوریزا در بستر کشت گیاه اضافه گردید. پس از چهار هفته TBSVبصورت مکانیکی به تیمارها مایهزنی شد و بررسی شدت علایم بیماری و نمونهبرداری از آن در نقطههای زمانی 19، 25 و 31 روز بعد از مایهزنی انجام گردید. تیمارها شامل گیاهان شاهد (C)، گیاهان آلوده به TBSV (V)، گیاهان مایکوریزایی (M) و گیاهان مایکوریزایی آلوده به ویروس TBSV (MV) بودند. نتایج بررسی علائم ویروسی، با استفاده از شاخص شدت بیماری، بیانگر کاهش شدت بیماری در گیاهان MV در مقایسه با گیاهان V بود. در تأیید این نتایج، میزان تکثیر ویروس نیز در گیاهان MV کاهش معنیداری نشان داد و این کاهش در مراحل پیشرفتهتر بیماری مشخصتر بود. بررسی بیان ژنهای مرتبط با متیلاسیون شامل MET1، HEN1 و ADK توسط تکنیک Real-time PCR نشان داد که این ژنها در گیاهان MV در مقایسه با گیاهان V بصورت معنیدار افزایش بیان داشتهاند. افزایش بیان ژنهای مرتبط با متیلاسیون در گیاهان MV نشان میدهد که مقاومت به ویروس احتمالاً از مسیر متیلاسیون اتفاق میافتد و علاوه بر این تأیید کننده تکثیرکمتر ویروس در گیاهان گوجهفرنگی تلقیح شده با مایکوریزا میباشد.https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_7113_b5b59257ffccfdd16c0f3c430eea8aa7.pdfدانشگاه پیام نورفصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی2252-0783103020200922Molecular validation of genes responsive to salinity stress and evaluation of their allelic diversity in mutant riceاعتبارسنجی مولکولی ژنهای پاسخگو به تنش شوری و ارزیابی تنوع آللی آنها در موتانتهای برنج5769710910.30473/cb.2020.54391.1815FAمرتضیاولادی قادیکلائیدانشجوی دکتری اصلاح نباتات دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، پژوهشکده ژنتیک و زیستفناوری کشاورزی طبرستان، ساری، ایران.قربانعلینعمت زادهاستاد گروه اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، پژوهشکده ژنتیک و زیستفناوری کشاورزی طبرستان، ساری، ایرانغلامعلیرنجبردانشیار گروه اصلاح نباتات، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایرانسیدحمید رضاهاشمیگروه مهندسی ژنتیک و بیولوژی، پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایرانJournal Article20200701Marker-assisted selection (MAS), a selective method which is not influenced by environmental factors. The success of MAS-based breeding programs depends on the selection and validation of the markers used. In this study, to validate the gene(s) associated with salinity stress and evaluation of allelic diversity of these markers in mutant rice lines, Band pattern of 18 SSR markers on a leaf sample of 14 mutant lines (M9) of rice, along with 2 susceptible controls (IR29 and Sepidrood) and 2 tolerant controls (Nonabokra and Dylmani) in 1398 in Genetics & Agricultural Biotechnology Institute of Tabarestan (GABIT). 11 primers were selected based on band pattern analysis in susceptible / tolerant cultivars. The molecular analysis results showed that OsMAPK4, OsCML11 and OsCPK17 had highest polymorphic information content (PIC). OsMAPK4 and OsCML11 had highest marker index (MI) at a rate of 0.23. The lowest PIC (0.05) and MI (0. 11) was accounted for OsCAX (D). Cluster analysis of molecular data, divided rice genotypes into three distinct groups. However, analysis of Biplot classified the genotypes into four different groups. In this study, 3 genes OsCML11, OsMAPK4 and OsCPK17 were identified on chromosomes 1, 6 and 7 respectively, as the most efficient primers in identifying the genetic diversity between the rice genotypes, considering that these primers have a very high linkage with salinity resistance genes, can be predicted that 3 lines G1 (M9-P1-7-2-1), G8 (M9-P3-21-1-1) and G9 (M9-P6 -7-1-1) have high tolerance to salinity stress.انتخاب به کمک نشانگر (MAS) نوعی گزینش بوده که تحت تأثیر محیط نیست. موفقیت برنامههای بهنژادی بر پایه MAS به انتخاب و اعتبارسنجی آغازگرهای مورد استفاده بستگی دارد. در این تحقیق، جهت اعتبارسنجی ژن (های) مرتبط با تنش شوری و ارزیابی تنوع آللی این آغازگرها در لاینهای موتانت برنج، الگوی باندی 18 نشانگر SSR، بر روی نمونه برگی 14 لاین موتانت (M9) برنج، به همراه 2 شاهد حساس (IR29 و سپیدرود) و 2 شاهد متحمل (Nonabokra و دیلمانی) در سال 1398 در پژوهشکده ژنتیک و زیست فناوری کشاورزی طبرستان بررسی شد. 11 آغازگر بر مبنای تحلیل الگوی باندی در ارقام حساس/ متحمل انتخاب گردیدند. آنالیز مولکولی دادهها نشان داد که بیشترین محتوای اطلاعات چندشکلی(PIC) مربوط به آغازگرهای OsMAPK4، OsCML11 وOsCPK17 بهترتیب به میزان 46/0، 46/0 و 38/0 بود. بالاترین شاخص نشانگر(MI) مربوط به دو آغازگر OsMAPK4 و OsCML11، به میزان 23/0 بود. آغازگر OsCAX (D) دارای کمترین PIC و MI بهترتیب به میزان 05/0 و 11/0 بود. لاینهای موتانت مورد مطالعه توسط تجزیه کلاستر و بای پلات به ترتیب به 3 و 4 گروه تقسیم شدند. سه آغازگر OsCML11، OsMAPK4 وOsCPK17 بهترتیب بر روی کروموزومهای 1، 6 و 7 بهعنوان کاراترین آغازگرها در شناسایی میزان تنوع ژنتیکی بین ژنوتیپهای برنج مورد ارزیابی در این مطالعه شناسایی شدند. نظر به اینکه آغازگرهای نامبرده پیوستگی بسیار بالایی با ژنهای مقاومت به شوری دارند میتوان پیشبینی کرد که لاینهای G1 (M9-P1-7-2-1)، G8 (M9-P3-21-1-1) و G9 <br />
(M9- P6-7-1-1) تحمل بالایی به تنش شوری داشته باشند.https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_7109_85c880a0b5d8083699ed2e921cb4829a.pdfدانشگاه پیام نورفصلنامه علمی زیست فناوری گیاهان زراعی2252-0783103020200927Genome wide bioinformatics analysis BES1 gene family in Vitis vinifera L.مطالعه بیوانفورماتیکی خانواده ژنی BES1 در گستره ژنوم Vitis vinifera L.7186711210.30473/cb.2020.54046.1813FAعلی رضالادن مقدمگروه باغبانی، واحد گرمسار، دانشگاه آزاد اسلامی، گرمسار، ایرانJournal Article20200609Brassinosteroids (BRs) are the plant-specific steroidal hormones that regulate a broad spectrum of plant growth and developmental processes under normal conditions and various biotic, and abiotic stresses. BES1 transcription factors regulate the expression of brassinosteroid-responsive genes. Completion of the grape genome sequencing enabled us to undertake a genome-wide identification of the gene families in this plant. Therefore, we performed a genome-wide investigation of BES genes in grape. The physicochemical properties, phylogeny tree, gene structure, conserved motifs, cis-acting elements, miRNA, and gene chip expression of the grape BES1 transcription factors were analyzed using the bioinformatics tools. The results showed that the grape BES1 transcription factors had seven members, which clustered into three subgroups according to the phylogenetic analysis. Each subgroup was well defined by the conserved motifs, implying that close genetic relationships could be identified among the members of each subgroup. According to the chromosomal locations, 1, 1, 2, 1, 1, and 1 genes were located on chromosomes 2, 4, 10, 15, 18, and 19, respectively. The analysis of cis-acting elements indicated that BES1 genes contained response elements of hormones and abiotic stresses, as well as organ-specific elements. The miRNA target analysis indicated that VvBES1-1, VvBES1-3, and VvBES1-5 contained miRNA target position in grape. Gene chip expression profile analysis revealed that the expression patterns of the grape BES1 genes were different in different organs and developmental stages. The analysis of this gene family would provide some theoretical basis for understanding the evolution and function of the BES1 genes in the grape.برازینواستروئیدها (Brassinosteroids) هورمونهای استروئیدی گیاهی هستند که کارکرد متنوعی در تنظیم طیف وسیعی از فرآیندهای رشد و نموی و همچنین پاسخ به تنشهای زیستی و غیرزیستی ایفا میکنند. عوامل رونویسی BES1 در تنظیم بیان ژنهای واکنشگر به برازینواستروئید نقش حیاتی دارند. تکمیل توالییابی ژنوم انگور محققان را قادر ساخته است که خانوادههای ژنی را در گستره ژنوم انگور شناسایی و مطالعه کنند. لذا در این تحقیق ژنهای خانواده BES1 شناسایی و مطالعه شد. ویژگیهای فیزیکوشیمیایی، درخت فیلوژنی، ساختار ژنی، موتیفهای حفاظت شده، عناصر تنظیمی، تنظیم بیان پس از رونویسی و پروفایل بیانی ژنهای شناسایی شده انجام شد. نتایج نشان داد که انگور دارای هفت ژن BES1 میباشد که بر اساس آنالیز فیلوژنتیکی در 3 زیر گروه قرار میگیرند. هر زیرگروه موتیفهای حفاظت شده داشته که نشان دهنده روابط ژنتیکی نزدیک در بین اعضاء هر زیر گروه است. بر اساس جایگاه کروموزومی 1، 1، 2، 1، 1 و 1 ژن به ترتیب بر روی کروموزومهای 2، 4، 10، 15، 18 و 19 قرار دارند. آنالیز ناحیه پیشبر ژنهای BES1 نشان داد که این ژنها دارای عناصر پاسخ به هورمونها، تنشها و نیز اختصاصی بافت میباشند. همچنین ژنهای VvBES1-1، VvBES1-3 و VvBES1-5 دارای جایگاه اتصال مولکولهای miRNA هستند. پروفایل بیانی این ژنها بر اساس دادههای ریزآرایه حاکی از الگوی بیانی متفاوت ژن-های BES1 انگور در بافتها در مراحل نموی مختلف میباشد. مطالعه این خانواده اساس تئوریتیکال لازم برای درک تکامل و کارکرد خانواده ژنی BES1 در انگور را مهیا میکند.https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_7112_d06fa2f59b09134e5985639d4e0002d7.pdf