<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE ArticleSet PUBLIC "-//NLM//DTD PubMed 2.7//EN" "https://dtd.nlm.nih.gov/ncbi/pubmed/in/PubMed.dtd">
<ArticleSet>
<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>10</Month>
					<Day>31</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Comparative transcriptome analysis of Safflower (Carthamus tinctorius L.) with oilseed crops to identify genes involved in seed oil quantity and quality</ArticleTitle>
<VernacularTitle>بررسی ترنسکریپتوم مقایسه‌ای گلرنگ با ‏دانه‌های روغنی به‌منظور شناسایی ژن‌های ‏دخیل در کمیت و کیفیت روغن دانه</VernacularTitle>
			<FirstPage>1</FirstPage>
			<LastPage>17</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">12366</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.71265.1968</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>سهیل</FirstName>
					<LastName>نهران باد</LastName>
<Affiliation>دانش‌آموخته کارشناسی ارشد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه بین‌المللی امام خمینی، قزوین، ایران.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>قاسمعلی</FirstName>
					<LastName>گروسی</LastName>
<Affiliation>استاد، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشگاه بین‌المللی امام خمینی، قزوین، ایران.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>سید مهدی</FirstName>
					<LastName>علوی</LastName>
<Affiliation>دانشیار، پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک و زیست فناوری، تهران، ایران.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>محمد امین</FirstName>
					<LastName>باقری</LastName>
<Affiliation>. پژوهشگر، گروه بیوتکنولوژی و اصلاح ‌نباتات، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی ساری، ساری، ایران.</Affiliation>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>1403</Year>
					<Month>02</Month>
					<Day>24</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>This study aimed to identify genes involved in seed growth and development using RNA-Seq and comparative transcriptomics. For this purpose, the transcriptome data of oilseed plants safflower, camelina, and soybean were extracted from relevant databases. After checking the quality of the data, they were edited, cleaned, and reassembled using the reference genome. Annotation of genes involved in seed fatty acid biosynthesis by identifying Arabidopsis homologs and then analyzing differentially expressed genes (DEGs) was performed. Genes with differential expression during seed development stages were identified, and in this way genes with significant expression and involved in seed fatty acid metabolism and synthesis pathways were extracted. Finally, the relationship between genes was drawn by protein-protein interaction network, and based on this, FAD2, FATB, and ACX4 genes were found to be effective in the lipid biosynthesis pathway during filling and maturation stages. In these plants in the glycerophospholipid metabolism pathway, NPC3, PDAT1, and LPAT1 genes showed significant differential expression during the start of seed growth and seed filling stages. The results showed that SDP1 and LPAT5 genes have an increased expression in the maturation stage compared to seed formation. In the fatty acid elongation pathway, KCS5 and C86A1 genes, in the fatty acid degradation pathway AIM1 gene, and in the fatty acid biosynthesis pathway FABH gene showed significant expression in the seed filling and maturation stages. Based on the protein-protein interaction network and gene relationships, it is likely that FAD2, FATB, and PDAT1 genes play a key role in seed development and oil biosynthesis.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">در این مطالعه که برپایه فناوری RNA-Seq و ترنسکریپتومیکس مقایسه‌ای بنا شده، به تجزیه و تحلیل و شناسایی ژن‌های دخیل در رشد و نمو دانه پرداخته شده است. بدین منظور داده‌های ترنسکریپتوم دانه گیاهان روغنی گلرنگ (رقم گلدشت)، کملینا و سویا از پایگاه‌ داده‌های مربوطه استخراج شد. پس از بررسی کیفیت، ویرایش، پاکسازی و  سرهم‌بندی مجدد آن‌ها  با استفاده از ژنوم مرجع انجام شد. حاشیه‌نویسی ژن‌های درگیر در بیوسنتز اسید چرب دانه توسط شناسایی هومولوگ‌های آرابیدوپسیس و سپس آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها (DEG) انجام شد. ژن‌هایی که دارای تفاوت بیان در مراحل نموی دانه بودند شناسایی و بدین ترتیب ژن‌های واجد بیان معنی‌دار و دخیل در مسیرهای متابولیسم و سنتز اسید چرب دانه استخراج شدند. در نهایت ارتباط بین ژن‌ها توسط شبکه پروتئین-پروتئین ترسیم و بر این اساس، ژن‌های FAD2، FATB و ACX4 در مسیر بیوسنتز لیپیدها در مرحله پرشدن و بلوغ موثر شناخته شدند. در این گیاهان در مسیر متابولیسم گلیسرولیپید نیز ژن‌های NPC3، PDAT1 و  LPAT1 بین مرحله شروع رشد دانه تا پر شدن دارای تفاوت بیان معنی‌داری بودند. نتایج نشان داد که ژن‌های SDP1 و LPAT5 در مرحله بلوغ نسبت به تشکیل دانه افزایش بیان دارند. در مسیر طویل‌سازی اسید چرب، ژن‌های KCS5 و C86A1، در مسیر تجزیه اسید چرب ژن‌ AIM1 و در مسیر بیوسنتز اسید چرب ژن FABH دارای افزایش بیان در مراحل پرشدن و بلوغ دانه بیان معنی‌داری را نشان دادند. بر اساس شبکه پروتئین-پروتئین و روابط بین ژن‌ها احتمال می‌رود ژن‌های FAD2، FATB و PDAT1 نقش کلیدی در نمو دانه و بیوسنتز روغن دانه داشته باشند.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">اسیدهای چرب</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">بیوانفورماتیک</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">ترنسکریپتوم مقایسه‌ای</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">دانه‌های روغنی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">گلرنگ</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_12366_d0f67289e026145ee4ded3e47dc88832.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>

<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>09</Month>
					<Day>13</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Setting up the DNA ladder Production line in order to use in electrophoresis</ArticleTitle>
<VernacularTitle>راه‌اندازی خط تولید مارکر اندازه ‏‎ DNAبرای استفاده در الکتروفورز ‏</VernacularTitle>
			<FirstPage>19</FirstPage>
			<LastPage>27</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">12369</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.72897.1991</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>امین</FirstName>
					<LastName>سهندی خلیفه کندی</LastName>
<Affiliation>گروه بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>مقصود</FirstName>
					<LastName>پژوهنده</LastName>
<Affiliation>گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، کیلومتر 35 جاده تبریز- آذرشهر، ایران.</Affiliation>
<Identifier Source="ORCID">0000-0003-1640-8169</Identifier>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2024</Year>
					<Month>11</Month>
					<Day>25</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>DNA markers are the solution of DNA fragments of different lengths. These markers are used to evaluate the results of the polymerase chain reactions (PCR) and the enzymatic digestion reactions, to confirm the vectors containing the desired DNA fragment, to study the genetic variation by molecular markers in different organisms and in other methods used in molecular genetics, biotechnology and in medical diagnostic applications. DNA ladder is an essential tool in agarose or polyacrylamide gel electrophoresis and its price is high due to the high production cost. By comparing the movement of known fragments of a ladder on the electrophoresis gel, the size (base pair) of unknown fragments obtained in a test can be estimated. In this study a new method for producing a high-consumption and low-production-cost DNA size marker was presented. The PCR technique was performed on a plant gene to obtain the desired fragments with different sizes of 100 bp. The interested fragments were cloned separately into pKS plasmid using an enzymatic digestion site at both ends. The recombinant plasmids were amplified in bacteria. Finally, by a simple enzymatic digestion with a common enzyme (BamHI) on plasmids extracted from bacteria, all the necessary fragments were obtained to produce the expected DNA size marker. In this applicable research, the production line of a DNA marker was set up. This produced ladder with a range of 100 to 3000 bp fragments has a wide use in medical research and diagnosis.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">مارکرهای DNA محلول‌هایی از قطعات DNA با طول‌های مختلف هستند. این مارکرها برای بررسی نتایج واکنش‌های زنجیره‌ای پلی‌مراز، واکنش‌های برش آنزیمی،  بررسی وکتورهای حاوی قطعه DNA مورد نظر، بررسی تنوع ژنتیکی در مارکرهای مولکولی موجودات مختلف و سایر روش‌های مورد استفاده در ژنتیک مولکولی، بیوتکنولوژی و تشخیص طبی کاربرد دارند. مارکر اندازه DNA یک ابزار ضروری در انجام الکتروفورز بر روی ژل آگارز و پلی آکریل‌آمید می‌باشد که به سبب بالا بودن هزینه تولید، قیمت بالایی دارد. با مقایسه میزان حرکت قطعات شناخته شده مارکر بر روی ژل در الکتروفورز می‌توان اندازه قطعات مجهول حاصل از آزمایش را بر حسب جفت باز تخمین زد. در این پژوهش شیوه‌ای جدید برای تولید یک مارکر اندازه DNA با قابلیت مصرف بالا و هزینه تولید پایین‌تر ارایه گردید. ابتدا جهت دست-یابی به قطعات با اندازه‌های مورد نظر با تفاوت 100 جفت باز از PCR روی یک ژن گیاهی استفاده شد. قطعات مورد نظر بطور جداگانه  به‌کمک سایت برشی یک آنزیم در پلاسمید pKS همسانه‌سازی گردید. پلاسمید‌های نوترکیب با انتقال به باکتری تکثیر یافتند. در نهایت از طریق برش آنزیمی با تنها یک آنزیم رایج (BamHI) روی مخلوط پلاسمید‌های استخراج شده از باکتری‌ها، تمام قطعات مورد نیاز برای تولید مارکر اندازه DNA مورد انتظار بدست آمدند. در این پژوهش کاربردی مقدمات و خط تولید یک مارکر DNA راه اندازی شد. مارکر تولیدی با طیفی از قطعات 100 تا 3000 جفت باز می‌تواند قابلیت استفاده وسیعی در تحقیقات مولکولی و تشخیص طبی داشته باشد. با تولید صنعتی آن نیاز بازار کشور از لحاظ تامین این ماده وارداتی با هزینه‌ای بسیار پایین‌تر برطرف می‌شود.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">الکتروفورز</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">مارکرDNA</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">همسانه سازی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">PCR</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_12369_ec2c944bd8773c6bc7341a74f9e436c3.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>

<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>08</Month>
					<Day>26</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Primary field evaluation of transgene in some cotton transgenic lines against Lepidoptera pests</ArticleTitle>
<VernacularTitle>بررسی مقدماتی عملکرد تراژن در ایجاد مقاومت مزرعه‌ای نسبت به آفات بالپولکدار در لاین‌های تراریخته پنبه</VernacularTitle>
			<FirstPage>29</FirstPage>
			<LastPage>41</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">12368</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.72568.1986</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>سیدالیاس</FirstName>
					<LastName>مرتضوی</LastName>
<Affiliation>پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران، صندوق پستی 1897-31535.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>مرتضی</FirstName>
					<LastName>عرب‌سلمانی</LastName>
<Affiliation>مرکز تحقیقات و آموزش کشاورزی و منابع طبیعی استان تهران، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، ورامین، تهران</Affiliation>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2024</Year>
					<Month>10</Month>
					<Day>22</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>In order to evaluate characteristics related to Lepidoptera pest resistance in some transgenic cotton lines, different transgenic events from Cocker100 variety harbouring cryIAb gene were tested in a field experiment. The other plant materials were consisted from two backcrossed lines resulted from MON531 event and CIM-448 line, and a Chinese commercial transgenic cotton cultivar harbouring cryIAc gene named 11F1 as positive control, and Khordad and Varamin cultivars as the non-transgenic negative control were used in the experiment. A randomaized complete block design with three replications was adopted as the statistical model. Infestation of the field during growing season was take palce in six stages to ensure that the field was infected uniformly by the pest. The characters related to the pest resistance trait were recorded during growing season. The results showed that non-transgenic cultivars comprising Varamin and Khordad experienced 24.7 and 23 percent respectively, the maximum boll contamination, while transgenic lines showed a contamination range from relatively suseptable (%19) to relative resistance (%2.5). Also, Maximum damage index of the pest were exhibited in the Varamin and Khordad cultivars with %6.4 and %5.9 respectively, while the index for transgenic lines varied from %5 to %0.6. In general, the transgenic A and B lines showed acceptable bollworm resistance characters. More investigations are needed to confirm other agronomic and fiber quality to be considered in commercialization of the lines.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">نظر به اینکه پس از تولید محصول تراریخته در آزمایشگاه، انجام آزمایش‌های میدانی به منظور اطمینان از بروز ژن در شرایط واقعی مزرعه‌‌ای ضروری است، پنج لاین پنبه تراریخته حاوی ژن cryIAb، به همراه سه لاین تراریخته حاوی ژن cryIAc و دو رقم تجاری غیرتراریخته خرداد و ورامین به عنوان شاهد در یک آزمایش مزرعه‌ای محصور در یک فصل در قالب طرح بلوک‌های کامل تصادفی با سه تکرار کاشته شده و مورد ارزیابی قرار گرفتند. در این آزمایش، پس از آلوده‌سازی مزرعه با لارو کرم غوزه، میزان آلودگی لاین‌های مورد بررسی در برابر آفت کرم غوزه در قالب تعداد غوزه در بوته، تعداد آلودگی غوزه در بوته، تعداد آلودگی برچه در بوته، و خسارت به غوزه در بوته مورد شمارش قرار گرفت و داده‌ها به صورت درصد بیان شدند. هم‌چنین شاخص خسارت آفت نیز مورد محاسبه قرار گرفت. نتایج آنالیز داده‌ها با نرم‌افزار SAS نشان داد که لاین‌های غیرتراریخته ورامین و خرداد به ترتیب با 7/24 و 23 درصد بیشترین آلودگی غوزه را داشته‌اند ولی میزان آلودگی در لاین‌های تراریخته متفاوت بود و از نسبتاً حساس (19 درصد) تا نسبتاً مقاوم (5/2 درصد) تغییر می‌کرد. هم‌چنین بیشترین شاخص خسارت آفت با 4/6 و 9/5 درصد به ترتیب برای لاین‌های غیرتراریخته ورامین و خرداد بود ولی این شاخص در لاین‌های تراریخته مورد مطالعه از 5 درصد تا 6/0درصد  تغییر می‌کرد. در مجموع نتایج این بررسی مقدماتی نشان داد که دو لاین تراریخته A و B حاوی تراژن cryIAc دارای کمترین میزان آلودگی و خسارت هستند.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">آلودگی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">ارزیابی مزرعه‌ای</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">پنبه تراریخته</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">شاخص خسارت</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_12368_310a591c13527f05ba2263fec6165750.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>

<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>09</Month>
					<Day>10</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Identification, functional prediction, and verification of key lncRNAs involved in potato (Solanum tuberosum L.) tuberization under nitrogen deficiency stress</ArticleTitle>
<VernacularTitle>شناسایی، پیش‌بینی عملکرد و اعتبارسنجی ‌LncRNAs‌‌ کلیدی درگیر در غده‌زایی سیب‌زمینی تحت تنش کمبود ازت</VernacularTitle>
			<FirstPage>43</FirstPage>
			<LastPage>56</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">12367</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.72513.1985</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>امین اله</FirstName>
					<LastName>چلوی</LastName>
<Affiliation>گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>فرهاد</FirstName>
					<LastName>نظریان فیروزآبادی</LastName>
<Affiliation>گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم‌آباد، ایران</Affiliation>
<Identifier Source="ORCID">0000-0002-8291-3887</Identifier>

</Author>
<Author>
					<FirstName>سید سجاد</FirstName>
					<LastName>سهرابی</LastName>
<Affiliation>گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>ابوذر</FirstName>
					<LastName>سورنی</LastName>
<Affiliation>گروه بیوتکنولوژی کشاورزی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان، ایران</Affiliation>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2024</Year>
					<Month>10</Month>
					<Day>16</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>Nitrogen (N) is one of the most important nutrients needed for the growth and development of potato (Solanum tuberosum L.). In the course of evolution, long non-coding RNA molecules (lncRNAs) have played a role in causing significant changes in plant’s responses to abiotic stresses. Given the limited information available on the mechanisms of action and the role of such important regulatory elements during potato tuber developmental stages, this study was conducted to identify and investigate the expression and function of lncRNAs, as well as their target genes, in response to nitrogen treatment. The results of the present study revealed that a total of 211 differentially expressed lncRNA molecules were detected under nitrogen treatment. Of these, four intergenic lncRNA sequences were differentially expressed under nitrogen treatment, and their target genes were associated with ion homeostasis, signal transduction, and protein degradation. The metabolic pathways most frequently associated with the target genes involved the biosynthesis of secondary metabolites, fatty acid metabolism, and fatty acid degradation. This study identified lncRNAs in potatoes under nitrogen treatment for the first time, marking a significant step towards understanding the function of lncRNA in plant’s responses to nitrogen. Identifying the location and function of these lncRNAs, along with the activity of differentially expressed genes, will provide valuable insights into the mechanisms underlying the plant&#039;s response to nitrogen.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">نیتروژن (N) یکی از مهمترین مواد غذایی برای رشد و نمو سیب‌زمینی (Solanum tuberosum L.) است. در جریان تکامل، تغییرات ژنتیکی حیاتی به‌وسیله مولکول‌های RNAهای بلند غیرکد‌کننده ( LncRNA Lon non coding RNAs:) در پاسخ گیاهان به تنش‌های غیرزیستی به‌وجود آمده است. با توجه به اینکه اطلاعات اندکی از مکانیسم عمل و نقش این عناصر مهم تنظیمی در مرحله نمو غده سیب‌زمینی در دسترس است؛ پژوهش حاضر با هدف شناسایی، بررسی بیان و کارکرد lncRNAها و همچنین ژن‌های هدف آن‌ها در پاسخ به تیمار ازت انجام شد. نتایج این مطالعه نشان داد که در مجموع تعداد 211 مولکول lncRNA با بیان متفاوت تحت تیمار ازت شناسایی شدند. از این تعداد 4 توالی lncRNA بین‌ژنی تحت تیمار ازت بیان متفاوت داشتند که ژن‌های هدف آن‌ها با رونوشت‌ ژن‌های مرتبط با هموستازی یونی، انتقال پیام و تخریب پروتئین همولوژی داشتند. مسیرهای متابولیکی با بیشترین فراوانی ژن‌های هدف شامل بیوسنتز متابولیت‌های ثانویه، متابولیسم اسیدهای چرب و تخریب اسیدهای چرب بودند. این مطالعه برای اولین‌بار توالی lncRNA را در سیب‌زمینی تحت تیمار ازت شناسایی نمود و به نظر می‌رسد گامی مفید در شناخت عملکرد lncRNA در چگونگی پاسخ گیاهان به تیمار ازت ‌باشد. مکان‌یابی و عملکرد این lncRNA و فعالیت ژن‌هایی با بیان افتراقی، سبب درک بهتر مکانیسم‌های پاسخ به تیمار ازت می‌شود.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">ژن‎های مرتبط با تنش</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">RNA غیرکدکننده</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">بیان ژن</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_12367_1aaf8a952fee97f15678ebf67e2a9c9f.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>

<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>09</Month>
					<Day>16</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>The effect of 24-epibrassinolide on chlorophyll parameters, physiological and biochemical traits of lettuce (Lactuca sativa L.) under salt stress.</ArticleTitle>
<VernacularTitle>اثر24-اپی براسینولید بر پارامترهای کلروفیل سبزینه، صفات فیزیولوژیک و بیوشیمیایی گیاه کاهو (Lactuca sativa L.)تحت تنش شوری</VernacularTitle>
			<FirstPage>57</FirstPage>
			<LastPage>68</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">12372</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.74198.2006</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>سید حسن</FirstName>
					<LastName>موسوی</LastName>
<Affiliation>پژوهشکده گلخانه و محیط های کنترل شده، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>زینب</FirstName>
					<LastName>چقاکبودی</LastName>
<Affiliation>گروه مهندسی تولید و ژنتیک گیاهی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی. دانشکده کشاورزی دانشگاه رازی کرمانشاه.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>محمدرضا</FirstName>
					<LastName>ایمانی</LastName>
<Affiliation>پژوهشکده گلخانه و محیط های کنترل شده، موسسه تحقیقات علوم باغبانی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران.</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>فرانک</FirstName>
					<LastName>رنجبر</LastName>
<Affiliation>گروه علوم و مهندسی خاک، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران.</Affiliation>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2025</Year>
					<Month>04</Month>
					<Day>01</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>Salinity stress affects plant growth and productivity by causing ion toxicity, disrupting water uptake, and altering hormonal balance. With the shift towards greenhouse-based vegetable and fruit production, selecting and evaluating lettuce genotypes with traits like heat, salinity, and drought tolerance is crucial to meeting production goals. Therefore, in this project, to identify salt-tolerant lines, promising lines numbered 20, 7, and 4, along with the local cultivar ‘Setareh’ and the foreign cultivars ‘Batavia’ and ‘Mignonette,’ were tested in a factorial experiment arranged in a completely randomized design with four replications in the greenhouse of the College of Agriculture and Natural Resources at Razi University, Kermanshah, during the 2023-2024 growing season. In this study, pots were irrigated with specific salinity levels (control, concentration of 10 mM NaCl/5 mM CaCl₂, concentration of 20 mM NaCl/10 mM CaCl₂, and concentration of 30 mM NaCl/15 mM CaCl₂). Salinity treatments were applied simultaneously after the third or fourth leaf stage. Various traits, including chlorophyll fluorescence, leaf greenness, total soluble sugar content, total phenol content, and total flavonoid content, were measured. The results showed that with increasing salinity levels, chlorophyll fluorescence parameters such as Fv/Fm (maximum quantum efficiency of PSII) and Y(PSII) (effective quantum yield of PSII) decreased, indicating a reduction in the photosynthetic efficiency of lettuce plant genotypes. This could lead to a decrease in plant growth and productivity. Additionally, the increase in salinity stress levels resulted in elevated levels of phytochemical compounds such as total soluble sugar content, total phenol content, and total flavonoid content.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">تنش شوری بر رشد و بهره وری گیاهان تأثیر میگذارد و باعث سمیت یونی، اختلال در جذب آب و تغییرات در تعادل هورمونی میشود. با توجه به انتقال تولید سبزیجات و میوهها به گلخانهها، انتخاب و ارزیابی ژنوتیپهای کاهو با صفاتی مانند تحمل به گرما، شوری و خشکی برای دستیابی به اهداف تولید ضروری است. لذا در این پروژه جهت شناسایی ژنوتیپهای متحمل به شوری ازژنوتیپهای شماره 20 و 7 و 4، همراه با رقم داخلی ستاره و ارقام خارجی لولاروزا و میگنونت آزمایشی به‌صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با چهار تکرار در گلخانه پردیس کشاورزی و منابعطبیعی دانشگاه رازی کرمانشاه در سال زراعی 1403-1402 انجام شد. در این بررسی، گلدانها با سطوح شوری مورد نظر (شاهد (آب شیر)، غلظت (10 میلی مولار نمک کلرید سدیم به 5 میلی مولار کلرید کلسیم، 20 میلی مولار نمک کلرید سدیم به 10 میلی مولار کلرید کلسیم و 30 میلی مولار نمک کلرید سدیم به 15 میلی مولار نمک کلرید کلسیم) آبیاری شدند. اعمال تیمارهای شوری، بعد از مرحله سه تا چهار برگی بهطور همزمان انجام شد. صفات مختلف شامل کلروفیل فلوروسانس، محتوای سبزینگی برگ، محتوای قند محلول کل، محتوای فنل کل و محتوای فلاونوئید کل اندازه گیری شدند. نتایج نشان داد که با افزایش سطوح شوری پارامترهای فلوروسانس کلروفیل مانند Fv/Fm (حداکثر کارایی فتوسیستم دو) و PI (شاخص فتوسنتزی) کاهش یافت که نشاندهنده کاهش کارایی فتوسنتزی ژنوتیپهای گیاه کاهو است. که این امر میتواند منجر به کاهش رشد و عملکرد گیاه شود. همچنین، افزایش سطوح تنش شوری باعث افزایش سطوح ترکیبات فیتوشیمیایی مانند محتوای قند محلول کل، فنل کل و محتوای فلاونوئید شد.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">محتوای سبزینگی برگ</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">محتوای قند کل</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">محتوای فلاونوئید کل</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">کاهو</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_12372_08be1334bc3d12f50013b7f006374dc8.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>

<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>09</Month>
					<Day>19</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Green Synthesis of Iron Oxid Nanoparticles Using Cressa Cretica leaf Extract and Investigating its Antimicrobial Efficacy</ArticleTitle>
<VernacularTitle>سنتز سبز نانوذرات اکسید آهن از عصاره برگی گیاه علف مورچه (Cressa cretica) و بررسی خواص ضد میکروبی آن</VernacularTitle>
			<FirstPage>69</FirstPage>
			<LastPage>83</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">11637</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.71377.1969</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>عظیم</FirstName>
					<LastName>سارانی</LastName>
<Affiliation>گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>لیلا</FirstName>
					<LastName>مهرآوران</LastName>
<Affiliation>استادیار گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>براتعلی</FirstName>
					<LastName>فاخری</LastName>
<Affiliation>گروه بیوتکنولوژی و اصلاح نباتات،  دانشکده کشاورزی،دانشگاه زابل، زابل، ایران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>مریم</FirstName>
					<LastName>اله دو</LastName>
<Affiliation>گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، ایران</Affiliation>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2024</Year>
					<Month>05</Month>
					<Day>19</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>In order to green synthesis of iron nanoparticles, the leaf extract of Cressa cretica L. was used as a reducing agent. In order to green synthesize iron oxide nanoparticles, the extract of Cressa cretica L. was used as a reducing agent. Within a few minutes of adding iron sulfate to leaf the extract of Cressa cretica L., iron oxide nanoparticles were formed. The first sign of the synthesis of nanoparticles was the change in the color of the solution from yellow to dark brown. The synthesized nanoparticles were analyzed by various techniques such as ultra-violet spectrophotometry, XRD, FT-IR, TEM. In the spectrum obtained from the UV-spectrophotometer, the peak appeared at 280 nm, which indicates the transfer of oxygen electrons to iron synthesized from Cressa. The XRD spectrum depicted the crystal structure of the synthesized iron oxide nanoparticles. The uniform spherical particles of the synthesized iron oxide nanoparticles with an average size of 21 nm were visible using TEM images. The FT-IR spectrum shows the presence of functional groups of plant chemicals that probably play a role in the formation and stabilization of nanoparticles. These results confirm the presence of flavonoid and phenolic compounds in leaf  extract. These compounds can be responsible for the reduction of metal ions and the formation of nanoparticles. Synthetic iron oxide nanoparticles showed effective inhibition against Staphylococcus aureus, These results indicate the possible effective use of synthetic nanoparticles in the production of antibacterial drugs and various biological applications.</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">به منظور سنتز سبز نانوذرات اکسید آهن، از عصاره گیاه علف مورچه (Cressa cretica L.) به عنوان عامل احیا کننده استفاده گردید. نانوذرات اکسید آهن در عرض چند دقیقه بعد از اضافه کردن سولفات آهن به عصاره گیاهی تشکیل شد. تغییر رنگ محلول از زرد به قهوه‌ای تیره اولین نشانه سنتز نانوذرات بود. نانوذرات اکسید آهن سنتز شده با تکنیک‌های مختلفی مانند اسپکتروفتومتر مرئی بنفش، XRD، FT-IR، TEM تجزیه و تحلیل شدند. در بررسی UV-اسپکتروفتومتر، پیک روی شاخص 280 نانومتر مشاهده شد که نشان‌دهنده انتقال الکترون اکسیژن به آهن سنتز شده از علف مورچه می‌باشد. طیف XRD ساختار کریستالی نانوذرات اکسید آهن سنتز شده را به تصویر کشید. بر اساس این نتایج،θ 2= 64/35 و 42/43 سنتز نانوذرات اکسید آهن را تایید کردند. تصاویر TEM ذرات کروی شکل یکنواخت نانوذرات سنتز شده را با میانگین اندازه 21 نانومتر نشان داد. طیف FT-IR وجود گروه‌های عاملی از مواد شیمیایی گیاهی را نشان می‌دهد که احتمالا در تشکیل و تثبیت نانوذرات نقش دارند. این نتایج حضور ترکیبات فلاونوئیدی و فنولی را در عصاره برگ علف مورچه تایید می‌کنند. این ترکیبات می‌توانند مسئول کاهش یون فلز و تشکیل نانوذرات باشند. نانوذرات سنتزی، مهار موثری در برابر استافیلوکوکوس اورئوس، استرپتوکوکوس پیوژنز و اشریشیا کلی نشان دادند به طوری که در غلظت µg/ml 3000، ناحیه مهاری 7 میلی‌متر برای باکتری اشریشیا کولی و 14 میلی‌متر برای استرپتوکوکوس پیوژنز مشاهده شد. نتایج نشان‌دهنده امکان سنتز نانوذرات آهن از عصاره برگ علف مورچه و کاربرد احتمالا موثر نانوذرات در تولید داروهای ضد باکتری و فرآیندهای بیولوژیکی می‌باشد.</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">ترکیبات آنتی اکسیدانی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">خواص فیزیکی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">سنتز زیستی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">علف مورچه</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">فعالیت ضد باکتریایی</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_11637_2faad858e884288817637c4e201c0d2a.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>

<Article>
<Journal>
				<PublisherName>دانشگاه پیام نور</PublisherName>
				<JournalTitle>فصلنامه علمی  زیست فناوری گیاهان زراعی</JournalTitle>
				<Issn>2252-0783</Issn>
				<Volume>14</Volume>
				<Issue>4</Issue>
				<PubDate PubStatus="epublish">
					<Year>2025</Year>
					<Month>08</Month>
					<Day>23</Day>
				</PubDate>
			</Journal>
<ArticleTitle>Risk Assessment of Genetically Modified Products: A Comprehensive Review</ArticleTitle>
<VernacularTitle>ارزیابی مخاطرات محصولات تراریخته: بررسی دیدگاه‌های خرد و کلان</VernacularTitle>
			<FirstPage>83</FirstPage>
			<LastPage>98</LastPage>
			<ELocationID EIdType="pii">12643</ELocationID>
			
<ELocationID EIdType="doi">10.30473/cb.2025.72719.1987</ELocationID>
			
			<Language>FA</Language>
<AuthorList>
<Author>
					<FirstName>فریده</FirstName>
					<LastName>قوی پنجه</LastName>
<Affiliation>گروه محیط زیست، پژوهشگاه مواد و انرژی</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>بهروز</FirstName>
					<LastName>زارعی</LastName>
<Affiliation>دانشکده کارآفرینی، دانشگاه تهران</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>جلال</FirstName>
					<LastName>رستم‌زاده</LastName>
<Affiliation>ژنتیک، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان</Affiliation>

</Author>
<Author>
					<FirstName>جواد</FirstName>
					<LastName>کریمی</LastName>
<Affiliation>استادیار زیست شناسی، دانشکده علوم، دانشگاه شیراز</Affiliation>
<Identifier Source="ORCID">0000-0002-6430-7349</Identifier>

</Author>
</AuthorList>
				<PublicationType>Journal Article</PublicationType>
			<History>
				<PubDate PubStatus="received">
					<Year>2024</Year>
					<Month>11</Month>
					<Day>07</Day>
				</PubDate>
			</History>
		<Abstract>In recent years, the extensive use of genetically modified products derived from genetic engineering technology has raised significant concerns regarding their biosafety, particularly in relation to food, human health, and the environment. This article aims to highlight the necessity of establishing a comprehensive risk assessment system at the macro level for genetically modified products, clarify the mechanisms underlying their potential risks, introduce various risk assessment approaches, and examine the essential tools required for designing such a system using large-scale system design methodologies. Given the complexity of this design process—which must account for artifacts, individuals, tools, processes, organizations, and the broader environment—the research adopts a qualitative, design-based methodology. This study explores three critical stages: identifying potential risks, elucidating the mechanisms of risk emergence, and designing appropriate assessment methods for genetically modified products. Based on these analyses, an integrated risk assessment framework that incorporates both micro- and macro-level perspectives is proposed. Ultimately, the establishment of robust evaluation and regulatory systems for genetically modified products, along with periodic reviews to ensure continuous improvement, must be prioritized in parallel with advancements in the scientific production and commercialization of these products.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;
, , , , , , , , ,  ,, , , , ,</Abstract>
			<OtherAbstract Language="FA">در سال‌های اخیر، به‌خاطر مصارف بالای محصولات تراریخته‌ی حاصل از فناوری ژنتیکی، مسائل ایمنی زیستی آن‌ ها به دلیل ارتباط با غذا و سلامت انسان و محیط زیست، مورد توجه جدی‌تر قرار گرفته است. هدف این مقاله بررسی ضرورت تدوین سیستم ارزیابی مخاطرات محصولات تراریخته در سطح کلان، تبین فرآیند ایجاد مخاطرات محصولات تراریخته، معرفی رویکردهای مختلف برای ارزیابی مخاطرات این محصولات و بررسی ابزارهای لازم برای طراحی این سیستم با بهره‌گیری از روش های طراحی سیستم‌های بزرگ مقیاس است. به‌دلیل پیچیده بودن فعالیت طراحی که بایستی ملاحظات مربوط به مصنوعات، افراد، ابزارها، فرآیندها، سازمان‌ها، و محیطی که در آن واقعه رخ می دهد، مورد توجه قرار گیرد، روش کار این تحقیق، کیفی و برمبنای روش تحقیق مبتنی بر طراحی است. در این تحقیق، بررسی های لازم درخصوص سه مرحله شناسایی مخاطرات، تبین سازوکارهای ایجاد مخاطرات و در نهایت طراحی و تبیین روش های ارزیابی محصولات تراریخته مورد بحث قرار گرفت و بر این اساس، رویکرد یکپارچه ارزیابی مخاطرات متشکل از سطوح خرد و کلان معرفی گردید. در نهایت ایجاد سیستم‌های ارزیابی و نظارتی محصولات تراریخته و بازنگری‌های دوره‌ای آن، به‌منظور بهبود مستمر، بایستی هم‌تراز با موضوعات علمی تولید و فروش این محصولات مورد توجه قرار گیرد. . . .</OtherAbstract>
		<ObjectList>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">ارزیابی مخاطرات</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">ایمنی زیستی</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">سیاست‌گذاری سلامت</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">محصولات تراریخته</Param>
			</Object>
			<Object Type="keyword">
			<Param Name="value">نظام یکپارچه سلامت</Param>
			</Object>
		</ObjectList>
<ArchiveCopySource DocType="pdf">https://cropbiotech.journals.pnu.ac.ir/article_12643_710d63620d76ace5433c1f48d6c362d0.pdf</ArchiveCopySource>
</Article>
</ArticleSet>
