کشاورزی مولکولی
نسیم احتشام راثی؛ احمد روحی بخش؛ بیتا سهیلی مقدم؛ ناهید مسعودی
دوره 8، شماره 22 ، شهریور 1397، ، صفحه 51-64
چکیده
ویروس S سیبزمینی (PVS) متعلق به جنس Carlavirus از تیره Betaflexiviridae یکی از ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. به منظور ردیابی ویروس S سیبزمینی، نمونهبرداری از مزارع سیبزمینی استان اردبیل، طی تابستان سالهای 95-1394، صورت گرفت. گیاهان محک در گلخانه، به منظور بررسی بیولوژیکی نمونههای برگی مشکوک به آلودگی، مایه زنی شدند. نمونهها ...
بیشتر
ویروس S سیبزمینی (PVS) متعلق به جنس Carlavirus از تیره Betaflexiviridae یکی از ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. به منظور ردیابی ویروس S سیبزمینی، نمونهبرداری از مزارع سیبزمینی استان اردبیل، طی تابستان سالهای 95-1394، صورت گرفت. گیاهان محک در گلخانه، به منظور بررسی بیولوژیکی نمونههای برگی مشکوک به آلودگی، مایه زنی شدند. نمونهها با آزمون الیزا از نظر آلودگی به ویروس PVS مورد بررسی قرار گرفتند. جهت ردیابی مولکولی، از روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مربوط به ناحیه پروتئین پوششی ویروس PVS استفاده شد. توالی نوکلئوتیدی ژن پروتئین پوششی مربوط به دو جدایه از ویروس (با رسشمار MH159207 و MH159208) جدا شده از ارقام آگریا و اوشینا تعیین شد. توالی پروتئین پوششی دو جدایه با یکدیگر و با 29 جدایه دیگر قابل دسترسی در بانک ژن مقایسه شد. درخت تبارزایی رسم شده نشان داد که جدایهها به دو گروه اصلی I (زیرگروههای IA وIB ) و II تقسیم شدند. دو جدایه Ag-9-PVS-F و Os-11-PVS-F در زیرگروه IB همراه با جدایههای آذربایجان، کرمان، همدان و اصفهان و جدایههایی از مجارستان، اوکراین، اسکاتلند و هند قرارگرفتند. همردیفی توالی اسیدآمینه فرضی پروتئین پوششی دو جدایه مورد بررسی با شش جدایه ایرانی و پنج جدایه خارجی این ویروس بیانگر اختلاف در هشت و 25 اسیدآمینه به-ترتیب برای جدایههای Ag-9-PVS-F و Os-11-PVS-F بود. نتایج نشاندهنده وجود جدایههای متنوع ویروس PVS در کشور بوده و تفاوت در توالی اسید نوکلئوتیدی و اسید آمینهای میتواند حاکی از تفاوت در منشا جفرافیایی و به تبع آن نحوه و زمان ورود جدایههای ویروس به منطقه باشد.
بیوتکنولوژی بیماریهای گیاهی
محمد امین الماسی
دوره 6، شماره 14 ، شهریور 1395، ، صفحه 73-84
چکیده
ویروس موزاییک یونجه (Alfalfa mosaic virus, AMV) در ایران که سبب بیماری در محصول یونجه (Medicago sativa) می شود، بر اساس خصوصیات مورفولوژیکی و بیان علایم شناسایی تشخیص داده میشود. روش های متعددی جهت تشخیص این ویروس وجود دارند که می توان به آزمون های سرولوژیک و روشهای مولکولی اشاره کرد. آزمون نسخه برداری معکوس تکثیر هم دمای وابسته به حلقه (revers transcription ...
بیشتر
ویروس موزاییک یونجه (Alfalfa mosaic virus, AMV) در ایران که سبب بیماری در محصول یونجه (Medicago sativa) می شود، بر اساس خصوصیات مورفولوژیکی و بیان علایم شناسایی تشخیص داده میشود. روش های متعددی جهت تشخیص این ویروس وجود دارند که می توان به آزمون های سرولوژیک و روشهای مولکولی اشاره کرد. آزمون نسخه برداری معکوس تکثیر هم دمای وابسته به حلقه (revers transcription loop mediated isothermal amplification) روش جدیدی جهت تکثیر RNA تحت شرایط هم دما، با اختصاصیت، حساسیت، سرعت و کارایی بالا است که در این پژوهش جهت تشخیص ویروس موزاییک یونجه به کار گرفته شد. به منظور انجام آزمون سرولوژیک، نمونه های برگی (100 نمونه) با علائم مشابه به ویروس موزاییک یونجه از سطح استان های همدان و کردستان جمع آوری شدند. چهار آغازگر واکنش RT-LAMP (شامل F3، B3، FIP و BIP) به همراه آغازگرهای واکنش RT-PCR (شامل F و B) بر اساس توالی بسیار حفاظت شده ای از ژن پوشش پروتئین (CP) طراحی شدند. جهت انجام آزمون های مولکولی، RNA کل استخراج و واکنش های مولکولی انجام شدند و در نهایت شش نمونه مثبت تشخیص داده شد. از مزایای این روش جدید در مقایسه با سایر روش های پیشین میتوان به اختصاصیت بالا، حساسیت بالا، سرعت بالا، کارآیی بالا، ایمنی، سهولت، عدم نیاز به تجهیزات پرهزینه جهت تکثیر، عدم نیاز به کارهای تشخیصی بعد از تکثیر، تشخیص مشاهده ای و کاربردوستی آن اشاره کرد.
بیوتکنولوژی گیاهان دارویی
سارا عبدخانی؛ محمود سلوکی؛ یعثوب شیری
دوره 4، شماره 8 ، اسفند 1393، ، صفحه 21-30
چکیده
گیاه Ocimum basilicum L. از خانواده نعناعیان است که دارای ترکیبات حلقوی و اسانس بوده و خواص ضد باکتریایی و آنتیاکسیدانی دارد، که سرشار از ترکیبات فنیل پروپانوئیدی است. آنزیم فنیلآلانین آمونیالیاز یکی از آنزیمهای کلیدی در مسیر تولید ترکیبات فنیل پروپانوئیدی میباشد. شواهد نشان میدهد که هورمونهای گیاهی بر بیان ژن در گیاهان مؤثر بوده ...
بیشتر
گیاه Ocimum basilicum L. از خانواده نعناعیان است که دارای ترکیبات حلقوی و اسانس بوده و خواص ضد باکتریایی و آنتیاکسیدانی دارد، که سرشار از ترکیبات فنیل پروپانوئیدی است. آنزیم فنیلآلانین آمونیالیاز یکی از آنزیمهای کلیدی در مسیر تولید ترکیبات فنیل پروپانوئیدی میباشد. شواهد نشان میدهد که هورمونهای گیاهی بر بیان ژن در گیاهان مؤثر بوده و موجب افزایش تولید متابولیتهای ثانویه میگردند. علاوه بر این سیستم دفاعی گیاه را از طریق فعالسازی رونویسی ژنهای مرتبط با مکانیسم دفاعی گیاه تحریک نموده باعث تنظیم مقاومت القایی میگردند. در این تحقیق، بیان ژن فنیلآلانینآمونیالیاز و فعالیت آنزیم فنیلآلانینآمونیالیاز در گیاه ریحان تحت تیمار هورمونهای اسید جیبرلیک، اسید جاسمونیک و اسید سالیسیلیک با غلظت 1/0 میلیمولار در لیتر با روش Real Time PCR در مراحل رشدی گیاهچهای، پیشگلدهی و گلدهی مورد بررسی قرار گرفت. اختلاف سطوح بیان ژن با روش دانکن در سطح 05/0P≤ مقایسه و آنالیزها توسط نرم افزار SAS v9 صورت گرفت. نتایج نشان دهنده افزایش در میزان بیان ژن و فعالیت آنزیم فنیلآلانینآمونیالیاز در تیمار هورمون اسید جاسمونیک در مرحله گلدهی بود. بیان ژن فنیلآلانینآمونیالیاز بین تیمار هورمونهای اسید جیبرلیک، اسید جاسمونیک و اسید سالیسیلیک و نمونه شاهد در سطح احتمال 5 درصد معنادار بود. تیمار اسید جاسمونیک، اسید جیبرلیک و اسید سالیسیلیک باعث افزایش بیان ژن و فعالیت آنزیم فنیلآلانینآمونیالیاز شد.
بیوتکنولوژی بیماریهای گیاهی
فاطمه حسینی؛ رضا پوررحیم؛ مژده ملکی؛ شیرین فرزادفر
دوره 3، شماره 4 ، شهریور 1392، ، صفحه 119-131
چکیده
و ویروس A سیبزمینی (PVA) از جمله ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. در بهار وتابستان 1389، تعددا 280 و463 نمونه برگی بهترتیب علائمدار و تصادفی و نیز تعداد 1336 غده از مزارع سیبزمینی استانهای خراسان رضوی و مرکزی جمعآوری وکل نمونهها با استفاده از آزمون الایزا از نظر آلودگی به ویروس PVA مورد بررسی قرار گرفتند. ...
بیشتر
و ویروس A سیبزمینی (PVA) از جمله ویروسهای مهم خسارتزا در سیبزمینی میباشد. در بهار وتابستان 1389، تعددا 280 و463 نمونه برگی بهترتیب علائمدار و تصادفی و نیز تعداد 1336 غده از مزارع سیبزمینی استانهای خراسان رضوی و مرکزی جمعآوری وکل نمونهها با استفاده از آزمون الایزا از نظر آلودگی به ویروس PVA مورد بررسی قرار گرفتند. نتایج حاصل بیانگر گسترش آلودگی به این ویروس در 39 و 10 درصد نمونههای علائمدار، 24 و 5 درصد نمونههای تصادفی و 17 و 13 درصد غدههای جمعآوریشده بهترتیب از دو استان مرکزی و خراسان رضوی بود. همچنین دامنه میزبانی جدایههای PVA بهدست آمده در شرایط گلخانه روی 10 جنس و گونه گیاه محک مورد بررسی قرار گرفت. با استفاده از روش RT-PCR ناحیه ژن پروتئین پوششی (CP) چهار جدایه PVA، تکثیر و توالی آن تعیین شد (رسشمار). توالی نوکلئوتیدی ژن CP چهار جدایه ایرانی PVA با توالی مربوطه در 37 جدایه خارجی این ویروس مورد مطالعه و مقایسه قرار گرفته و درخت تبارزایی رسم گردید. در این درخت، 41 جدایه مورد بررسی بر اساس ژن CP به دو گروه اصلی I (شامل دو زیرگروه IA و IB) و II تقسیم شدند. سه جدایه ایرانی Ar2، Kh4 و F2 از استان مرکزی در زیرگروه IA دارای بیشترین شباهت با جدایههایی از آلمان و هلند (بهترتیب Y11427 و X91968) و جدایه Gh4 در زیر گروه IB دارای بیشترین شباهت با جدایهای از چین (DQ309063) بود. این اولین مطالعه در زمینه روابط تبارزایی جدایههای ایرانی PVA و نیز اولین گزارش از وقوع آلودگی به این ویروس در مزارع سیبزمینی استان مرکزی میباشد. نتایج حاصله نشاندهنده حضور واریانتها و جدایههای متنوع این ویروس در کشور بوده و این اطلاعات در تهیه و اصلاح ارقام مقاوم سیبزمینی در برابر این ویروس حائز اهمیت است.