بیوانفورماتیک
مریم مرتضائی فر؛ رضا فتوت؛ فرید شکاری؛ شهریار ساسانی
دوره 7، شماره 17 ، خرداد 1396، ، صفحه 55-71
چکیده
شرایط محیطی منجر به ساخت ملکولهای پیامرسان از جمله فیتوهورمونها در گیاهان میگردد که وظایف مهمی بعنوان پیامرسان اولیه در مسیر ترارسانی و تنظیم فعالیتهای سوخت و ساز سلول را بعهده دارند. هورمون جاسمونیکاسید با کنترل عاملهای رونویسی در فرآیندهای نموی و پاسخ گیاهان به تنشهای مختلف نقشی کلیدی ایفا میکند. با وجود مطالعات ...
بیشتر
شرایط محیطی منجر به ساخت ملکولهای پیامرسان از جمله فیتوهورمونها در گیاهان میگردد که وظایف مهمی بعنوان پیامرسان اولیه در مسیر ترارسانی و تنظیم فعالیتهای سوخت و ساز سلول را بعهده دارند. هورمون جاسمونیکاسید با کنترل عاملهای رونویسی در فرآیندهای نموی و پاسخ گیاهان به تنشهای مختلف نقشی کلیدی ایفا میکند. با وجود مطالعات فراوان صورت گرفته، پاسخ گیاهان به این هورمون بهطور کامل شناخته نشده است. در اینجا، دادههای ریزآرایه مربوط به گیاه آرابیدوپسیس از پایگاه داده GEO برای آنالیز شبکه همبیانی مورد استفاده قرار گرفت. از تجزیه تحلیل آنها با روش WGCNA (شبکه همبیانی ژنی وزندار)، 25 گروه ژنی (ماژول) بدست آمد که پروفایل بیانی آنها در پاسخ به جاسمونیکاسید با یکدیگر دارای همبستگی معنیدار بالایی بود. برای بررسی معنیداربودن آماری هر ماژول از نظر زیستی از تجزیه و تحلیل هستیشناسی ژن استفاده شد. نتایج نشان داد که فرآیندهای زیادی از جمله فتوسنتز، مرگ برنامهریزی شده سلول و پاسخ به تنشهای مختلف به وسیله جاسمونات کنترل شدند. علاوه براین، تعداد زیادی عامل رونویسی، برای مثال 11 ژن از خانواده NAC و 12 ژن از خانواده bHLH، در تنظیم پاسخهای جاسمونیکاسید نقش داشتند و فرآیندهایی همچون پاسخ به تنشهای زیستی و غیر زیستی، نمو گل و پاسخ به نور را کنترل نمودند.
بیوتکنولوژی و تنش های زنده و غیرزنده
خدیجه نوروزی نوروزی؛ رضا فتوت؛ فرید شکاری؛ احسان محسنی فرد
دوره 6، شماره 15 ، آذر 1395، ، صفحه 1-11
چکیده
شوریخاک از مهمترین تنش های غیرزیستی است که شدیداً تولید محصول را کاهش می دهد. مطالعات اخیر نشان داده است که کاربرد بیرونی سالیسیلیکاسید بهعنوان یک ملکول مهم در مسیر ترارسانی در انتقال پیام های تنش های غیرزیستی نقش دارد. با وجود این نقش آن در ترارسانی تنش شوری روشن نیست. در این تحقیق اثر غلظت های مختلف سالیسیلیکاسید، در بیان ژن ...
بیشتر
شوریخاک از مهمترین تنش های غیرزیستی است که شدیداً تولید محصول را کاهش می دهد. مطالعات اخیر نشان داده است که کاربرد بیرونی سالیسیلیکاسید بهعنوان یک ملکول مهم در مسیر ترارسانی در انتقال پیام های تنش های غیرزیستی نقش دارد. با وجود این نقش آن در ترارسانی تنش شوری روشن نیست. در این تحقیق اثر غلظت های مختلف سالیسیلیکاسید، در بیان ژن های گیرنده ی شبهکینازی دو رقم جو (ریحان و نصرت) متفاوت از لحاظ مقاومت به شوری مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که شوری و سالیسیلیکاسید تأثیر معنی داری بر صفات گیاهچهای جو داشتهاند و موجب افزایش بیان نسبی ژن های Hv3ARK و IdiRLK2 در رقم نصرت شدند. ولی در رقم ریحان بیان نسبی ژن ها متفاوت بود. به نظر می رسد سالیسیلیکاسید با فعال کردن گیرندههای شبهکینازی در مسیر انتقال پیام شوری قرار دارد. این نتایج نشان می دهد که برخی از گیرنده های شبهکینازی، ممکن است در پاسخهای بواسطه سالیسیلیکاسید در گیاهان تحت تنش های غیرزیستی نقش داشته باشند.