نوع مقاله : علمی پژوهشی
نویسندگان
- پروین امانی داز 1
- حسین حسینی مقدم 2
- حسین صبوری 3
- ابراهیم غلامعلی پور علمداری 2
- سیده معصومه حسینی 4
- سمیه سنچولی 5
1 دانشجوی سابق بیوتکنولوژی، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنیدکاووس، ایران.
2 استادیار، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنیدکاووس، ایران.
3 دانشیار، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنیدکاووس، ایران.
4 دانشجوی سابق بیوسیستماتیک گیاهی، دانشگاه آزاد اسلامی گرگان، گرگان، ایران.
5 دانشجوی دکتری زراعت- فیزیولوژی گیاهی، گروه تولیدات گیاهی، دانشکده علوم کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه گنبد کاووس، گنیدکاووس، ایران.
چکیده
شناسایی نشانگرهای پیوسته به ژنهای کنترل کننده تحمل به خشکی از نیازهای اصلاح ارقام برنج با عملکرد زیاد در نواحی خشک میباشد. به منظور مکانیابی QTLهای کنترل کننده تحمل به تنش خشکی در برنج، 96 لاین نوترکیب F8 برنج حاصل از تلاقی اهلمیطارم و ندا در قالب طرح کاملاً تصادفی با سه تکرار، تحت شرایط تنش خشکی در آزمایشگاه گیاهشناسی دانشکده کشاورزی دانشگاه گنبد کاووس در سال 1393 کشت شدند. نظر به وجود تنوع ژنتیکی بین لاینهای مورد مطالعه، امکان ردیابی QTLها در این بررسی فراهم شد. در محاسبه همبستگی صفات ارزیابی شده در شرایط تنش خشکی، بیشترین همبستگی مربوط به صفات قطر ریشه با چگالی سطح ریشه (**96/0) بود. نتایج تجزیه خوشهای براساس کل صفات در شرایط تنش خشکی، لاینهای مورد بررسی را در چهار گروه مقاوم، نیمه مقاوم، نیمه حساس و حساس به خشکی قرار داد. نقشه پیوستگی با استفاده از 30 نشانگر SSR و 20 نشانگر ISSR به دست آمد. طول نقشه پیوستگی 2/1413 سانتیمورگان با متوسط فاصله 18/12 سانتیمورگان بین دو نشانگر مجاور بود. در مجموع 13 فاصله واجد QTL برای صفات ارزیابی شده شناسایی شد که از این تعداد دو QTL طول ساقه، یک QTL تعداد ریشه، سه QTL عرض برگ، یک QTL وزن ساقه، سه QTL سطح برگ، یک QTL تراکم روزنه قبل تنش، یک QTL تراکم روزنه بعد تنش و یک QTL مجموع سطح روزنهها به سطح کل بعد تنش را کنترل نمود. از بین QTLهای ردیابی شده، qLL-2 و qSA-12 به ترتیب برای سطح برگ و تراکم روزنه بعد از تنش توانستند درصد بالایی از تغییرات فنوتیپی را توجیه نمایند. از نتایج این پژوهش بعد از تعیین اعتبار میتوان در برنامههای انتخاب به کمک نشانگر استفاده نمود.
کلیدواژهها
موضوعات
عنوان مقاله [English]
Mapping of QTLs related to morphophysiological traits in rice seedling (Oryza sativa L.) under drought condition
نویسندگان [English]
- Parvin Amani Daz 1
- Hossein Hossein Moghaddam 2
- Hossein Sabouri 3
- Ebrahim Gholamalipour Alamdari 2
- Sayedeh Masoomeh Hosseini 4
- Somayeh Sanchouli 5
1 1. Formar M.Sc. Student in biotechnology, Department of plant production, College of Agriculture Science and Natural Resource, Gonbad Kaous University, Gonbad Kaous, Iran.
2 Assistant Professor, Department of Plant Production, College of Agriculture Science and Natural Resource, Gonbad Kavous University, Gonbad Kaous, Iran.
3 Associate Professor, Department of Plant Production, College of Agriculture Science and Natural Resource, Gonbad Kavous University, Gonbad Kaous, Iran.
4 Former M.Sc. Student in Plant Biosystematics, Gorgan Azad University, Gorgan, Iran.
5 Ph.D. Candidate, Agronomy-Plant Physioligy, Department of Plant Production, College of Agriculture Science and Natural Resource, Gonbad Kaous University, Gonbad Kaous, Iran.
چکیده [English]
Identification of the linked markers to drought tolerance genes are needed for the breeding of rice varieties. In order to mapping of QTLs controlling related to drought tolerance, 96 rice Inbred lines caused Ahlamitarom × Neda cross planted as complementary randomized design with 3 replications under drought stress in Gonbad Kavous University lab in 2014. Given the genetic variation among the studied lines, it was possible to the detection of QTLs in this study. In calculating the correlation of traits evaluated under drought stress, the highest correlation was for root diameter with root area density (0.96 **). The results of cluster analysis based on total traits under drought stress, lines assigned to four groups: tolerant, semi-tolerant, semi-sensitive and sensitive. Linkage map provided using F8 population, 30 SSR markers, and 20 ISSR markers and covered 1413.2 cM with an average distance between two markers 12.18. QTL analysis indicated that containing totally 13 distances were found, in this way, 2 QTL stem length, 1 QTL root number, 3 QTL leaf width, 1 QTL stem weight, 3 QTL leaf surface, 1 QTL stomata density before stress, 1 QTL stomata density after stress, 1 QTL ratio of total stomata surfaces total area after stress were controlled. Of the detected QTLs, qLL-2 and qSA-12, explained a high percentage of phenotypic variation for leaf area and stomata density after stress. The major QTLs detected in this study, can be used in marker-assisted selection breeding programs after validation
کلیدواژهها [English]
- Drought stress
- Mapping of quantitative traits
- Rice
- SSR
- ISSR